对一条新的或者位置的序列,首先应该对基因序列进行生物信息学的分析,分析它的基本序列,比如开放阅读框,限制性内切酶位点,翻译蛋白质,查找同源性序列,等等,所以一切都必须通过具体的实验才能完成,但是在这之前我们必须先进行相应的生物信息学分析和预测,提高工作效率,减少不必要的工作和麻烦。因此必须作如下的前期工作:分析序列本身,查找开放阅读框,限制性内切酶位点,根据序列设计引物,进行PCR扩增,连接载体转化细胞,进行克隆,得到转化子表达蛋白质,得到相应的氨基酸序列,分析蛋白质及其作用和功能。因此首先就要通过相应的生物信息学软件进行前期分析,可以通过以下几个软件完成这一系列的工作,而且非常的漂亮完美。
NoeClone, NoePrimer和Seqcorator, 详情见下:
Seqcorator:先进的序列图形化修饰和展示软件。Seqcorator是一款全新的生物序列展示软件。Seqcorator先进的序列图形化展示功能,为实验设计,信息整合,海量内容展示以及绘制文献中高质量的图形提供了前所未有的灵活性和强大功能。
NoeClone: 克隆设计,管理和展示的先进虚拟克隆实验室。围绕熟悉的克隆项目进行设计, NoeClone组织了克隆流程,包括多图谱克隆流程图,电子克隆,先进的序列修饰,双向序列图谱协调,电子PCR,凝胶模拟以及许多常用的分析功能。
NoePrimer:界面精美清晰,操作简便的引物设计软件。NoePrimer为PCR引物设计带来了从未有过的简单方便。除了拥有常用的引物搜索和分析功能外,NoePrimer还拥有独特的高通量引物设计以及多分子和多重PCR引物设计功能。
强烈推荐大家去试用一下。可以到http://noegen.com下载试用版试用一下,呵呵 |